Больше не нужно искать — необходимые
обучающие материалы и подсказки всегда под рукой

Российский институт AIRI анонсировал нейросетевой инструмент GENATATOR для составления карты генов на основе последовательности ДНК.
Разработка определяет границы генов, распознаёт тип транскрипта и восстанавливает его внутреннее устройство.
Искусственный интеллект функционирует в несколько этапов: сначала выявляет вероятные точки начала и завершения транскрипции, затем анализирует промежутки между ними, корректирует структуру и отсеивает недостоверные варианты.
Инструмент предназначен для поиска как белок-кодирующих генов, так и генов длинных некодирующих РНК.
Обучение моделей проходило на генетическом материале человека и 38 других видов млекопитающих, среди которых моржи и слоны. В ходе испытаний GENATATOR продемонстрировал высокую эффективность также на плодовой мушке, растении резуховидка Таля и пекарских дрожжах.
По заявлению разработчиков, система значительно опережает существующие аналоги по уровню точности.
В AIRI отметили, что в отличие от традиционных методов, GENATATOR не ориентируется на отдельные маркеры вроде старт- и стоп-кодонов или сигналов сплайсинга. Нейросеть запоминает и выявляет закономерности в целых последовательностях ДНК.
Благодаря этому инструмент применим к геномам немодельных организмов, для которых нет детальных аннотаций.
Теоретически GENATATOR может быть полезен для изучения эволюционных процессов, поиска ранее неизвестных генов и анализа геномов вымерших животных. В медицине его можно задействовать для прогнозирования заболеваний, создания персонализированных препаратов и в биотехнологии.
Модели опубликованы в открытом доступе на платформе Hugging Face. Также запущены веб-сервис и открытый лидерборд для проверки качества работы.
Локальная версия функционирует только на графических процессорах с архитектурой CUDA, выводя данные в формате float32. Работа на центральном процессоре и режимы с пониженной точностью пока не поддерживаются.
Популярные новости: